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magattacaのブログ クイズ：どっちが自然の構造？ 〜RF diffusionで人工ペプチドを生成〜ムービーきっかけお題のタンパク質Google ColabでRF diffusion（hotspot指定なし）Google ColabでRF diffusion（hotspot指定あり）答えProteinMPNNによる残基の生成とAlphaFoldでの検証まとめ ニューモダリティはあなたの中に？　〜FMTが承認された話〜初のFMT、RebyotaCDIってどんな？Rebyota の有効性についてRebyotaだけじゃないよ！まとめと参考資料 静電ポテンシャルからタンパク質-リガンド複合体を眺めよう 〜パート②：Tyk2阻害剤への適用1. 計算対象2. ESPを計算して活性差を考察しよう3. おわりに 静電ポテンシャルからタンパク質-リガンド複合体を眺めよう 〜パート①：ESP-DNNの使い方〜1. ESP-DNN2. ESP-DNNをGoogle Colabで3. NGL viewerで可視化4. 拡張子PQRと謎の原子5. おわりに RDKitで３次元構造に水素原子を付加するときの設定（addCoords）よくやるミスaddCoords=Trueをつけると？何が起きてる？おわりに OpenMMをステップバイステップで　〜Part 10 全体のまとめと感想、あと失敗例〜1. 全体の総括2. きっかけと感想3. このシリーズでできなかったこと4. （おまけ）試したけどうまくいかなかったもの5. おわりに OpenMMをステップバイステップで 〜 Part 9 低分子-タンパク複合体のトラジェクトリ解析 〜1. キナーゼと阻害剤2. 低分子 - タンパク質複合体のトラジェクトリ解析3. おわりに view page

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