Category:分子動力学
フライングアイスキューブ効果
Flying ice cube
アンダーセン・サーモスタット
Andersen thermostat
局所上昇法
Local elevation
アントン (スーパーコンピュータ)
Anton (computer)
ベルレ・リスト
Verlet listベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostat
GPUを用いた分子モデリング
Molecular modeling on GPUs
陰溶媒
Implicit solvation
カー・パリネロ法
Car–Parrinello method
メタダイナミクス法
Metadynamics
能勢＝フーバー・サーモスタット
Nosé–Hoover thermostat
CHARMM
CHARMM
QM/MM
QM/MM
ポアソン＝ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equation
アンブレラサンプリング法
Umbrella sampling
レプリカ交換法
Parallel tempering
OPLS
OPLS
ベレの方法
Verlet integration
原子位置の二乗平均平方根偏差
Root mean square deviation of atomic positions
周期的境界条件
Periodic boundary conditions
分子動力学法
Molecular dynamics