Category:分子動力学
フライングアイスキューブ効果
Flying ice cube
カー・パリネロ法
Car–Parrinello method
メタダイナミクス法
Metadynamics
アンダーセン・サーモスタット
Andersen thermostat
局所上昇法
Local elevation
アントン (スーパーコンピュータ)
Anton (computer)
ベレの方法
Verlet integration
GPUを用いた分子モデリング
Molecular modeling on GPUs
ベルレ・リスト
Verlet list
QM/MM
QM/MM
陰溶媒
Implicit solvationベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostat
ポアソン＝ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equation
周期的境界条件
Periodic boundary conditions
CHARMM
CHARMM
OPLS
OPLS
アンブレラサンプリング法
Umbrella sampling
原子位置の二乗平均平方根偏差
Root mean square deviation of atomic positions
レプリカ交換法
Parallel tempering
能勢＝フーバー・サーモスタット
Nosé–Hoover thermostat
分子動力学法
Molecular dynamics