Category:分子動力学
メタダイナミクス法
Metadynamics
QM/MM
QM/MM
フライングアイスキューブ効果
Flying ice cube
OPLS
OPLS
ベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostatアンダーセン・サーモスタット
Andersen thermostat
局所上昇法
Local elevation
アントン (スーパーコンピュータ)
Anton (computer)
陰溶媒
Implicit solvation
ベルレ・リスト
Verlet list
GPUを用いた分子モデリング
Molecular modeling on GPUs
カー・パリネロ法
Car–Parrinello method
アンブレラサンプリング法
Umbrella sampling
CHARMM
CHARMM
ポアソン＝ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equation
能勢＝フーバー・サーモスタット
Nosé–Hoover thermostat
ベレの方法
Verlet integration
レプリカ交換法
Parallel tempering
原子位置の二乗平均平方根偏差
Root mean square deviation of atomic positions
周期的境界条件
Periodic boundary conditions
分子動力学法
Molecular dynamics