Category:分子動力学
レプリカ交換法
Parallel tempering
原子位置の二乗平均平方根偏差
Root mean square deviation of atomic positions
アンブレラサンプリング法
Umbrella sampling
ベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostat
フライングアイスキューブ効果
Flying ice cube
陰溶媒
Implicit solvationアンダーセン・サーモスタット
Andersen thermostat
OPLS
OPLS
カー・パリネロ法
Car–Parrinello method
局所上昇法
Local elevation
アントン (スーパーコンピュータ)
Anton (computer)
CHARMM
CHARMM
ベルレ・リスト
Verlet list
GPUを用いた分子モデリング
Molecular modeling on GPUs
ポアソン＝ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equation
能勢＝フーバー・サーモスタット
Nosé–Hoover thermostat
ベレの方法
Verlet integration
QM/MM
QM/MM
メタダイナミクス法
Metadynamics
周期的境界条件
Periodic boundary conditions
分子動力学法
Molecular dynamics