Category:分子動力学
フライングアイスキューブ効果
Flying ice cubeアンダーセン・サーモスタット
Andersen thermostat局所上昇法
Local elevationアントン (スーパーコンピュータ)
Anton (computer)ベルレ・リスト
Verlet listGPUを用いた分子モデリング
Molecular modeling on GPUsQM/MM
QM/MMベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostatカー・パリネロ法
Car–Parrinello method陰溶媒
Implicit solvationOPLS
OPLSCHARMM
CHARMMメタダイナミクス法
Metadynamicsアンブレラサンプリング法
Umbrella sampling能勢=フーバー・サーモスタット
Nosé–Hoover thermostatポアソン=ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equation原子位置の二乗平均平方根偏差
Root mean square deviation of atomic positionsレプリカ交換法
Parallel tempering周期的境界条件
Periodic boundary conditionsベレの方法
Verlet integration分子動力学法
Molecular dynamics