Category:分子動力学
ベレの方法
Verlet integration
アンブレラサンプリング法
Umbrella sampling
ポアソン＝ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equation
分子動力学法
Molecular dynamics
周期的境界条件
Periodic boundary conditions
カー・パリネロ法
Car–Parrinello method
CHARMM
CHARMM
フライングアイスキューブ効果
Flying ice cube
陰溶媒
Implicit solvation
アンダーセン・サーモスタット
Andersen thermostat
GPUを用いた分子モデリング
Molecular modeling on GPUs
局所上昇法
Local elevation
アントン (スーパーコンピュータ)
Anton (computer)
ベルレ・リスト
Verlet list
能勢＝フーバー・サーモスタット
Nosé–Hoover thermostatベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostat
OPLS
OPLS
QM/MM
QM/MM
メタダイナミクス法
Metadynamics
原子位置の二乗平均平方根偏差
Root mean square deviation of atomic positions
レプリカ交換法
Parallel tempering