Category:分子動力学
ベレの方法
Verlet integration
QM/MM
QM/MM
能勢＝フーバー・サーモスタット
Nosé–Hoover thermostat
ポアソン＝ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equation
OPLS
OPLS
フライングアイスキューブ効果
Flying ice cube
陰溶媒
Implicit solvation
アンブレラサンプリング法
Umbrella sampling
アンダーセン・サーモスタット
Andersen thermostat
メタダイナミクス法
Metadynamics
局所上昇法
Local elevation
アントン (スーパーコンピュータ)
Anton (computer)
ベルレ・リスト
Verlet list
GPUを用いた分子モデリング
Molecular modeling on GPUsベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostat
レプリカ交換法
Parallel tempering
CHARMM
CHARMM
カー・パリネロ法
Car–Parrinello method
周期的境界条件
Periodic boundary conditions
原子位置の二乗平均平方根偏差
Root mean square deviation of atomic positions
分子動力学法
Molecular dynamics