Category:分子動力学
カー・パリネロ法
Car–Parrinello method
アンブレラサンプリング法
Umbrella sampling
ポアソン＝ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equation
GPUを用いた分子モデリング
Molecular modeling on GPUs
CHARMM
CHARMM
能勢＝フーバー・サーモスタット
Nosé–Hoover thermostat
アンダーセン・サーモスタット
Andersen thermostat
局所上昇法
Local elevation
アントン (スーパーコンピュータ)
Anton (computer)
フライングアイスキューブ効果
Flying ice cube
ベルレ・リスト
Verlet listベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostat
陰溶媒
Implicit solvation
原子位置の二乗平均平方根偏差
Root mean square deviation of atomic positions
OPLS
OPLS
メタダイナミクス法
Metadynamics
レプリカ交換法
Parallel tempering
ベレの方法
Verlet integration
QM/MM
QM/MM
分子動力学法
Molecular dynamics
周期的境界条件
Periodic boundary conditions