Category:分子動力学
ベレの方法
Verlet integration
アンブレラサンプリング法
Umbrella sampling
OPLS
OPLS
メタダイナミクス法
Metadynamics
フライングアイスキューブ効果
Flying ice cube
アンダーセン・サーモスタット
Andersen thermostat
GPUを用いた分子モデリング
Molecular modeling on GPUs
局所上昇法
Local elevation
アントン (スーパーコンピュータ)
Anton (computer)
ベルレ・リスト
Verlet listベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostat
能勢＝フーバー・サーモスタット
Nosé–Hoover thermostat
陰溶媒
Implicit solvation
ポアソン＝ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equation
CHARMM
CHARMM
カー・パリネロ法
Car–Parrinello method
QM/MM
QM/MM
周期的境界条件
Periodic boundary conditions
レプリカ交換法
Parallel tempering
原子位置の二乗平均平方根偏差
Root mean square deviation of atomic positions
分子動力学法
Molecular dynamics