Category:分子動力学
周期的境界条件
Periodic boundary conditions
分子動力学法
Molecular dynamics
ベレの方法
Verlet integration
メタダイナミクス法
Metadynamics
QM/MM
QM/MM
CHARMM
CHARMM
OPLS
OPLS
ポアソン＝ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equation
フライングアイスキューブ効果
Flying ice cube
陰溶媒
Implicit solvation
アンダーセン・サーモスタット
Andersen thermostat
局所上昇法
Local elevation
アントン (スーパーコンピュータ)
Anton (computer)
能勢＝フーバー・サーモスタット
Nosé–Hoover thermostat
ベルレ・リスト
Verlet list
GPUを用いた分子モデリング
Molecular modeling on GPUsベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostat
アンブレラサンプリング法
Umbrella sampling
原子位置の二乗平均平方根偏差
Root mean square deviation of atomic positions
レプリカ交換法
Parallel tempering
カー・パリネロ法
Car–Parrinello method