Category:分子動力学
フライングアイスキューブ効果
Flying ice cube
アンダーセン・サーモスタット
Andersen thermostat
局所上昇法
Local elevation
アントン (スーパーコンピュータ)
Anton (computer)
ベルレ・リスト
Verlet list
GPUを用いた分子モデリング
Molecular modeling on GPUsベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostat
陰溶媒
Implicit solvation
カー・パリネロ法
Car–Parrinello method
メタダイナミクス法
Metadynamics
QM/MM
QM/MM
CHARMM
CHARMM
能勢＝フーバー・サーモスタット
Nosé–Hoover thermostat
アンブレラサンプリング法
Umbrella sampling
ポアソン＝ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equation
OPLS
OPLS
原子位置の二乗平均平方根偏差
Root mean square deviation of atomic positions
レプリカ交換法
Parallel tempering
周期的境界条件
Periodic boundary conditions
ベレの方法
Verlet integration
分子動力学法
Molecular dynamics