Similar to フライングアイスキューブ効果

分子動力学法
Molecular dynamics
OPLS
OPLS
QM/MM
QM/MM
アンダーセン・サーモスタット
Andersen thermostat
アントン (スーパーコンピュータ)
Anton (computer)
アンブレラサンプリング法
Umbrella sampling
陰溶媒
Implicit solvation
カー・パリネロ法
Car–Parrinello method
局所上昇法
Local elevation
原子位置の二乗平均平方根偏差
Root mean square deviation of atomic positions
GPUを用いた分子モデリング
Molecular modeling on GPUs
周期的境界条件
Periodic boundary conditions
CHARMM
CHARMM
能勢=フーバー・サーモスタット
Nosé–Hoover thermostat
ベルレ・リスト
Verlet list
ベレの方法
Verlet integration
ベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostat
ポアソン=ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equation
メタダイナミクス法
Metadynamics
レプリカ交換法
Parallel tempering