Similar to メタダイナミクス法
陰溶媒
Implicit solvation
カー・パリネロ法
Car–Parrinello method
周期的境界条件
Periodic boundary conditions
CHARMM
CHARMM
能勢＝フーバー・サーモスタット
Nosé–Hoover thermostat
フライングアイスキューブ効果
Flying ice cube
ベレの方法
Verlet integration
ベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostat
ポアソン＝ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equation
レプリカ交換法
Parallel tempering