Similar to 能勢=フーバー・サーモスタット
アントン (スーパーコンピュータ)
Anton (computer)アンブレラサンプリング法
Umbrella sampling陰溶媒
Implicit solvationカー・パリネロ法
Car–Parrinello method局所上昇法
Local elevation原子位置の二乗平均平方根偏差
Root mean square deviation of atomic positionsGPUを用いた分子モデリング
Molecular modeling on GPUs周期的境界条件
Periodic boundary conditionsCHARMM
CHARMMフライングアイスキューブ効果
Flying ice cubeベルレ・リスト
Verlet listベレの方法
Verlet integrationベレンゼン・サーモスタット
Berendsen thermostatポアソン=ボルツマン方程式
Poisson–Boltzmann equationメタダイナミクス法
Metadynamicsレプリカ交換法
Parallel tempering